Procedimentos para a determinação da seqüência de nucleotídeos de um fragmento de DNA. Existem dois métodos comuns para fazer isso:

• a técnica Maxam e Gilbert (degradação química), que utiliza produtos químicos diferentes para quebrar o DNA em fragmentos em bases específicas; ou

• a técnica de Sanger (chamada o método de terminação de cadeia ou di-deoxy) usa DNA polimerase para fazer novas cadeias de DNA, com di-deoxy nucleotídeos (terminadores de cadeia) para parar a cadeia, aleatoriamente como cresce.

Em ambos os casos, os fragmentos de DNA são separados de acordo com o comprimento por eletroforese em gel de poliacrilamida, permitindo a seqüência ser lido diretamente do gel.