Na aplicação de biotecnologia para a agricultura, as principais áreas envolvem manipulação de plantas de colheita e manipulação de microbianas ou invertebrados associados de plantas cultivadas e ervas daninhas. Tecnológico objectivos podem ser alcançados por reprodução e seleção convencional ou por engenharia genética de plantas, micróbios ou invertebrados, ou através de manipulação do ambiente. Tais tecnologias podem ser combinadas em diferentes sistemas de cultivo com práticas tradicionais, como os pesticidas químicos ou fertilizantes. Jogo de fungos, uma expansão do papel em agribiotechnology como agentes de controle biológico, como micorrizos associados da planta de raízes, como agentes para a degradação da lignocelulose e outras formas de biorremediação (a aplicação de microorganismos para biodegradar poluentes) ou culturas de alimentos que utilizam resíduos agrícolas como substrato. Em alimentos e processamento de bebidas, fornecimento de fungos uma matriz de enzimas e aditivos de sabor e cor naturais.